Le principali proteine di fase acuta (APP) nei bovini sono l'aptoglobina (Hp) e la siero amiloide A (SAA), mentre, nei suini sono Hp, SAA, proteina C-reattiva (CRP) e la Pig Major Acute Phase Protein (Pig-MAP). Sono attualmente disponibili molte metodiche per misurare questi parametri, che sono ancora in fase di perfezionamento al fine di migliorarne la sensibilità, la specificità, la facilità d'uso e la disponibilità in termini economici. 

Nei bovini le principali applicazioni delle suddette proteine riguardano la diagnosi e il monitoraggio di malattie frequenti come mastiti e metriti delle vacche da latte e le patologie respiratorie dei giovani vitelli.